Selon la journaliste d'investigation Whitney Webb, le récit officiel de la création de Polymarket, selon lequel le fondateur Shayne Coplan aurait lancé l'entreprise de manière indépendante en 2020, est inexact. Webb retrace les origines de la plateforme à une société antérieure appelée TokenBnk et allègue des liens avec une entreprise de cryptomonnaie fondée par des proches du Premier ministre israélien Benjamin Netanyahu.
Webb affirme en outre que Polymarket sert essentiellement de renaissance privée du projet controversé du Pentagone, le Policy Analysis Market (PAM), dirigé par le capital-risqueur Peter Thiel et ses associés. L'initiative originale du PAM a été annulée en raison de controverses.